Некодирующие РНК играют важную роль в регуляции врожденной и адаптивной иммунной системы в норме и при развитии различных патологий, в том числе аутоиммуных заболеваний. Некоторые некодирующие РНК были идентифицированы как перспективные биомаркеры для диагностики ревматоидного артрита. Тем ни менее многие вопросы, связанные с механизмом действия, а также особенностями их функционирования при взаимодействии с различными лекарственными препаратами, все еще остаются не решенными. В настоящей работе получены новые данные об особенностях экспрессии длинных некодирующих РНК BALACAT1, DANCR1, MALAT1 и GAS5 в лейкоцитах периферической крови пациентов с ревматоидным артритом до назначения терапии и на фоне приема базисного противовоспалительного антиревматического препарата метотрексат. Статистически значимое повышение уровня транскриптов BALACAT1, DANCR1 и MALAT1 и снижение GAS5 в лейкоцитах периферической крови было выявлено у пациентов с ревматоидным артритом до назначения терапии и у пациентов резистентных к метотрексату в сравнении с контрольной группой здоровых доноров и больных ревматоидным артритом с положительным ответом на данный препарат (p=0.05). Выявлена положительная корреляционная зависимость между содержанием днРНК DANCR1, уровнем экспрессии IL6 (r=0.55, p=0.01) и концентрацией С-реактивного белка (r=0.48, p=0.03). Обнаружена корреляционная зависимость между исследуемыми днРНК и экспрессией генов, кодирующих мембранные транспортеры сем ABC (ABCB1) и SLC (RFC1). Уровень экспрессии ABCB1 находится в тесной положительной связи с MALAT1 и BALACAT1 (r=0.49, p<0.001; r=0.64, p<0.05), а гена SLC19A1, кодирующего фолатный переносчик RFC1, с GAS5 (r=0.55; p<0.001). Таким образом, результаты исследований свидетельствуют не только о вовлечении днРНК MALAT1, BALACAT1 и GAS5 в патогенез ревматоидного артрита, но и о вероятном участии их в формировании ответа пациентов на базисный антиревматический препарат метотрексат.