Сотрудники Института леса (ИЛ) КарНЦ РАН внесли существенный вклад в изучение разнообразия сосудистых растений, афиллофороидных и шляпочных грибов и лишайников Республики Карелия и сопредельных областей. Исследования сосудистых растений и различных групп грибов проводятся с момента создания ИЛ в 1957 г. и успешно продолжаются в настоящее время, постоянно ставя новые задачи и расширяя круг интересов территориально на весь Северо-Запад России. Лихенофлористическое направление появилось в ИЛ позднее (в 1985 г.) и также развивается. В ИЛ работали такие видные ученые, как доктора биологических наук М. Л. Раменская, В. И Шубин, В. И. Крутов и другие, внесшие огромный вклад в изучение биоразнообразия Восточной Фенноскандии и лесной зоны европейской части России в целом. Велика роль этих ученых и их учеников и последователей не только в познании видового разнообразия Карелии и смежных регионов, но и в решении различных вопросов охраны природы и рационального использования природных ресурсов, особенно лесных. Сотрудники ИЛ играют ведущую роль в формировании системы особо охраняемых природных территорий (ООПТ) Карелии, чему особенно способствовало то обстоятельство, что первая в республике ООПТ природный заповедник «Кивач» долгое время входил в состав ИЛ в ранге сектора. Сотрудники ИЛ участвовали в инвентаризации флоры и микобиоты и подготовке научных обоснований многих перспективных ООПТ; исследования продолжаются на ООПТ после их учреждения. Ботаники и микологи ИЛ подготовили первое (неофициальное) издание региональной Красной книги (1985), впоследствии участвовали как ведущие авторы в подготовке трех официальных изданий (1995-2020).