На двенадцати островах Онежского озера выявлено 145 видов афиллофоровых грибов, в том числе занесенных в Красную книгу Республики Карелия (2020): Gloeophyllum protractum, Junghuhnia collabens, J. pseudozilingiana, Polyporus badius, Rigidoporus crocatus и Tyromyces fissilis. Впервые для биогеографической провинции Karelia onegensis отмечены 4 вида. Все новые находки подтверждены гербарными образцами, хранящимися в гербарии КарНЦ РАН (PTZ). Большинство видов афиллофоровых грибов (94) выявлено на древесине лиственных пород, тогда как на хвойных породах – 53 вида. На рябине зарегистрировано 39 видов, на осине – 38, на сосне – 32, на ели и иве – по 25, на березе – 21. На обследованных островах выявлены местонахождения 18 индикаторных и специализированных видов для высоковозрастных (старовозрастных) лесов с минимальной антропогенной нарушенностью. Видовое богатство макромицетов изученной группы грибов каждого острова определяет комплекс факторов – состав древесных пород и присутствие валежа разной степени разложения, лесистость (скалистость), наличие разных типов местообитаний, степень антропогенного нарушения; размер острова не имеет существенного значения. Также приводятся краткие сведения об агарикоидных грибах.